Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ercc6l2Q9JIM3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ercc6l2Q9JIM3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms