Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copb1Q9JIF7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copb1Q9JIF7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms