Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF0

Prmt1, Protein arginine N-methyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prmt1Q9JIF0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Prmt1Q9JIF0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Prmt1Q9JIF0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms