Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cldn12Q9ET43 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Cldn12Q9ET43 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cldn12Q9ET43 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms