Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cmtm7Q9ESD6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cmtm7Q9ESD6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms