Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp29Q9ES63 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp29Q9ES63 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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