Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dap3Q9ER88 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dap3Q9ER88 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms