Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Stx12Q9ER00 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stx12Q9ER00 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms