Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Clca3a2Q9EQR4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Clca3a2Q9EQR4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms