Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQI5

Ppbp, Chemokine (C-X-C motif) ligand 7, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpbpQ9EQI5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PpbpQ9EQI5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PpbpQ9EQI5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms