Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rpgrip1Q9EPQ2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms