Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH4

Eif3f, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3fQ9DCH4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eif3fQ9DCH4 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eif3fQ9DCH4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms