Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
MNCb-2875Q9DCB3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms