Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Csnk1dQ9DC28 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1dQ9DC28 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms