Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Syvn1Q9DBY1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Syvn1Q9DBY1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms