Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ccdc97Q9DBT3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms