Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SrpraQ9DBG7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SrpraQ9DBG7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms