Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fundc1Q9DB70 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms