Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Atp5oQ9DB20 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Atp5oQ9DB20 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms