Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAT5

Trmu, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrmuQ9DAT5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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TrmuQ9DAT5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TrmuQ9DAT5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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TrmuQ9DAT5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TrmuQ9DAT5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TrmuQ9DAT5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TrmuQ9DAT5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TrmuQ9DAT5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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TrmuQ9DAT5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TrmuQ9DAT5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms