Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pfn3Q9DAD6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pfn3Q9DAD6 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms