Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rsph3bQ9DA80 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rsph3bQ9DA80 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms