Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc89Q9DA73 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms