Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Ift43Q9DA69 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Ift43Q9DA69 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ift43Q9DA69 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ift43Q9DA69 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Ift43Q9DA69 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ift43Q9DA69 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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