Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DA42 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DA42 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DA42 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DA42 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DA42 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DA42 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DA42 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DA42 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DA42 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DA42 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DA42 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DA42 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DA42 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DA42 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DA42 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms