Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cldnd2Q9D9H2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldnd2Q9D9H2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldnd2Q9D9H2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldnd2Q9D9H2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldnd2Q9D9H2 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldnd2Q9D9H2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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