Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg7Q9D906 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg7Q9D906 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms