Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Snx5Q9D8U8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snx5Q9D8U8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms