Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P4

Mrpl17, 39S ribosomal protein L17, mitochondrial, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl17Q9D8P4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Mrpl17Q9D8P4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mrpl17Q9D8P4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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