Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Derl3Q9D8K3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms