Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl4Q9D8E6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl4Q9D8E6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms