Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jam3Q9D8B7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Jam3Q9D8B7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms