Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fip1l1Q9D824 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fip1l1Q9D824 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms