Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Chmp5Q9D7S9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms