Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Tmem54Q9D7S1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tmem54Q9D7S1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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