Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Echdc3Q9D7J9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms