Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Chmp4cQ9D7F7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Chmp4cQ9D7F7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms