Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q9D7E4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q9D7E4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms