Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc52a3Q9D6X5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms