Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Q9D5Q8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Q9D5Q8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D5Q8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D5Q8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D5Q8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D5Q8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D5Q8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Q9D5Q8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms