Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Zcchc13Q9D548 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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