Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PrameQ9D4Z5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PrameQ9D4Z5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms