Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
4931423N10RikQ9D4J9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4931423N10RikQ9D4J9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms