Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lonrf3Q9D4H7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lonrf3Q9D4H7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms