Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clvs1Q9D4C9 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms