Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4933428M09RikQ9D3X3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4933428M09RikQ9D3X3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms