Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Snx20Q9D2Y5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx20Q9D2Y5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx20Q9D2Y5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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