Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SarnpQ9D1J3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms