Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F0

Rtl8b, CAAX box 1 homolog A (Human), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8bQ9D1F0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rtl8bQ9D1F0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rtl8bQ9D1F0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Rtl8bQ9D1F0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rtl8bQ9D1F0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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