Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tspan11Q9D1D1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tspan11Q9D1D1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms